多囊性卵巢症狀群的相關症狀牽連到生殖內分泌系統、胰島素、體重間緊密的互動關係使得此一問題相形複雜。與這個症狀相關的異常包括幾個現象：
臨床的異常
1.月經的異常：每年月經次數少於9次稱為寡月經（Oligomenorrhea），這是由於內分泌的關係造成卵巢功能的異常。常常有不能正常排卵的現象，使得造成不規則出血，經期過長，甚至於無月經(Amenorrhea)的現象；
2.不孕問題：多囊性卵巢症候群（PCOS）是造成無排卵性不孕最常見的原因，佔70% 以上。沒有正常的排卵，月經的規則性就會消失，婦女不知自己每個月的月事何時來臨。這些是由於內分泌的關係造成卵巢功能的異常，導致不規則出血、經期過長、甚至於無月經的現象。
如果一直沒有適當的月經週期，子宮內膜的生長也會不正常，因此會造成子宮內膜增生甚至增加子宮內膜癌的危險。這些婦女一但結婚後面臨生育時，因為長期不能正常排卵，也有不易懷孕的問題。這些婦女在不孕治療的過程中因為特殊的內分泌問題也需要特別的考量，PCOS婦女在懷孕後也有流產率增加的趨勢
女性體內的雄性素活性增加，會有幾種臨床表現
1. PCOS婦女常有較油性的皮膚，旺盛的皮脂腺活性造成在臉部或胸部及背部會長出青春痘（Acne）的機會增高，使得皮膚的照料較為困難。
2. 毛髮過多，而這些毛髮所長的位置多在對雄性素較敏感的臉部、腹部、或手及腿部，如鬍鬚，胸部或腹部，小腿或大腿及手臂等，也稱多毛症（hirsutism）；東方人在這方面的表現較不明顯；
3.在雄性素更高的情形下可能造成頭髮較細而稀疏即為雄性禿 （Androgen-dependent alopecia）；主要會發生在頭頂上的毛髮脫落；
代謝方面，約50-70%多囊性卵巢症候群婦女有血糖增高與胰島素敏感度降低的問題，比一般人得到第二形糖尿病的危險多5-6倍。近年來也發現胰島素代謝異常問題是短期與長期造成婦女生理異常的核心問題，許多研究也認為胰島素的增加是造成雄性素上升的主要原因，因此許多學者認為多囊性卵巢症候群主要是卵巢在胰島素作用功能失調的一個結果。
肥胖方面，半數的多囊性卵巢症候群婦女有肥胖的問題，這種肥胖與正常婦女的肥胖有些差異，正常婦女的肥胖是下半身的梨子型肥胖，而這些雄性素偏高的婦女肥胖常是上半身與腹部的蘋果型肥胖，蘋果型肥胖會加重原有的症狀使得雄性素過高與糖類代謝異常情形惡化。
其他皮膚問題，在頸部、鼠蹊部、腋下、及皮膚皺摺處有深的色素沉澱及厚的皮膚皺褶、這是一種胰島素異常的徵兆，常見於肥胖的PCOS婦女，稱為Acanthosis nigrican。
情緒及生活品質方面，憂鬱及焦慮。由於多囊性卵巢這些症狀，常讓病患對其外貌或其不孕的問題，因此有較高憂鬱及焦慮的症狀；生活品質也會受到影響，對症狀的處理可以減低病患憂鬱及焦慮。
長期而言，多囊性卵巢症候群的代謝異常除了有增加糖尿病的危險外，血液中三酸甘油脂偏高，好的膽固醇減少及壞的膽固醇增加等也會增加心贜血管疾病與高血壓的危險。
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